La Parroquia Eclesiástica de San Sebastián, fue creada en el año de 1650; pero tuvieron que transcurrir algunos años para que en el lugar se inicie la construcción de la iglesia; es así que en el año de 1900 el Rvdmo. Sr. D. Eliseo Álvarez comienza la edificación del amplio Templo en honor a la Virgen Santísima Inmaculada de Lourdes, cuya fiesta se celebraba antiguamente con gran concurrencia de gente, gracias al entusiasmo de dicho Sr. Canónigo.

Este Templo es uno de los más amplios de la Diócesis, fue decorado por el Rvdmo. Sr. Víctor Eguiguren, cuando era Párroco de San Sebastián; también se adecentó en gran parte, realizando la gruta para la Virgen Santísima de Lourdes,; el Rvdmo. Sr. José M. Rodríguez, cuando fue Párroco de la Iglesia realizó  la obra del altar de mármol y el mausoleo, para guardar los sagrados restos del que fue Rvdmo. Sr. Eliseo Álvarez. Además el Padre Julián Lorente ha hecho arreglar la fachada de Templo.

Esta iglesia consta de de tres naves, un retablo en cada una de ellas, en la nave derecha se encuentra el altar del Santísimo y en la izquierda la Capilla del Divino Niño. Entre lo más representativo de la iglesia se encuentra la imagen de San Sebastián y el retablo mayor que contienen elementos góticos, pináculos y arcos en crucería. En la parte superior existen dos pasamanos que rodean la parte interna y se sostienen con arquería de medio punto.

El primer viernes de enero de 1996, en el Templo de San Sebastián ocurrió un acontecimiento que sorprendió a toda la ciudadanía; en la Ostia Consagrada aparece la silueta de Jesús, y por esta razón el seis de junio del mismo año es elevado a Santuario Eucarístico Diocesano por Monseñor Hugolino Cerasuolo, Obispo de Loja.